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Activation of Silent Secondary Metabolite Gene Clusters in Bacteria

Secondary metabolites are of interest, because they can possess pharmaceutical activity, e.g. antibiotic, immunosuppressive or cytostatic activity.[1] The production profile of secondary metabolites is dependent on the cultivation conditions and can for example be altered by stress, e.g. addition of solvents, nutrient limitations, pH changes, and co-culturing, as several groups have shown.[2], [3]
The objective of this project is to activate silent secondary metabolite gene clusters through variation of culture condition in bacterial strains with high biosynthetic potential and to validate the previous bioinformatic analysis.

[1] W.-D. Deckwer, W. Ackermann, Thieme 1999.
[2] H. B. Bode, B. Bethe, R. Höfs, A. Zeeck, ChemBioChem 2002, 3 (7), 619.
[3] R. K. Pettit, Microbial biotechnology 2011, 4 (4), 471.



  • Schwarz, J. und Lütz, S. (2018)
    Influence of Nutrient Limitation on the Production Profile of Bacteria with High Biosynthetic Potential
    3rd European Conference on Natural Products, 2.-5. September 2018, Frankfurt am Main, Germany

  • Schwarz, J., Gröninger, B. und Lütz, S. (2017)
    Influence of the Cultivation Conditions on the Production Profile of Pyxidicoccus fallax HKI727
    DECHEMA Himmelfahrtstagung 2017, Neu-Ulm, Germany

  • Schwarz, J. und Lütz, S. (2017)
    Einfluss von Prozessbedingungen auf die Sekundärmetabolit-Produktion- P. fallax HKI727 als Beispiel für die Aktivierung stiller Gen-Cluster
    BioProcessingDays 2017, 20. - 22. Februar 2017, Recklinghausen, Germany

  • Schwarz, J. und Lütz, S. (2016)
    Abschätzung des biosynthetischen Potentials ausgewählter Bakterienstämme & Wie kann die Sekundärmetabolitproduktion angeregt werden?
    ProcessNet-Jahrestagung und 32. DECHEMA-Jahrestagung der Biotechnologen, 12. - 15. September 2016, Aachen, Germany